- Harmothoe abyssicola
- Harmothoe aculeata
- Harmothoe acuminata
- Harmothoe africana
- Harmothoe alba
- Harmothoe antilopes
- Harmothoe areolata
- Harmothoe aspera
- Harmothoe atra
- Harmothoe augeneri
- Harmothoe balboensis
- Harmothoe benthaliana
- Harmothoe benthophila
- Harmothoe borealis
- Harmothoe capensis
- Harmothoe charlottae
- Harmothoe ciliata
- Harmothoe commensalis
- Harmothoe cornuta
- Harmothoe craigsmithi
- Harmothoe crassicirrata
- Harmothoe crosetensis
- Harmothoe crucis
- Harmothoe dearborni
- Harmothoe derjugini
- Harmothoe dictyophora
- Harmothoe discoveryae
- Harmothoe discoveryensis
- Harmothoe eltanina
- Harmothoe ernesti
- Harmothoe evei
- Harmothoe exanthema
- Harmothoe extenuata
- Harmothoe flaccida
- Harmothoe forcipata
- Harmothoe fragilis
- Harmothoe fraserthomsoni
- Harmothoe fusca
- Harmothoe fuscaspinae
- Harmothoe gilchristi
- Harmothoe glabra
- Harmothoe globifera
- Harmothoe globosa
- Harmothoe gordae
- Harmothoe goreensis
- Harmothoe haliaeti
- Harmothoe hirsuta
- Harmothoe hollisi
- Harmothoe imbricata
- Harmothoe impar
- Harmothoe ingolfiana
- Harmothoe johnstoni
- Harmothoe joubini
- Harmothoe kergulensis
- Harmothoe lanceocirrata
- Harmothoe longidentis
- Harmothoe longisetis
- Harmothoe macginitiei
- Harmothoe macnabi
- Harmothoe magellanica
- Harmothoe malmgreni
- Harmothoe mexicana
- Harmothoe micraspis
- Harmothoe minuta
- Harmothoe norvegica
- Harmothoe oculinarum
- Harmothoe pagenstecheri
- Harmothoe praeclara
- Harmothoe propinqua
- Harmothoe pulchella
- Harmothoe quadrituberculata
- Harmothoe rarispina
- Harmothoe reticulata
- Harmothoe saldanha
- Harmothoe sanctaehelenae
- Harmothoe serrata
- Harmothoe setosissima
- Harmothoe spinifera
- Harmothoe spinosa
- Harmothoe spinulosa
- Harmothoe stephensoni
- Harmothoe tahitiensis
- Harmothoe tenebricosa
- Harmothoe tenuisetis
- Harmothoe trimaculata
- Harmothoe vagabunda
- Harmothoe vesiculosa
- Harmothoe villosa
- Harmothoe viridis
- Harmothoe waahli
- Harmothoe watsoni