Chromatomyia aizoon- Chromatomyia alpigenae
- Chromatomyia aprilina
- Chromatomyia aragonensis
- Chromatomyia asteris
- Chromatomyia beigerae
- Chromatomyia blackstoniae
- Chromatomyia caprifoliae
- Chromatomyia castillejae
- Chromatomyia centaurii
- Chromatomyia ciliata
- Chromatomyia clemativora
- Chromatomyia compta
- Chromatomyia crawfurdiae
- Chromatomyia deirdreae
- Chromatomyia dorsata
- Chromatomyia elgonensis
- Chromatomyia erigerontophaga
- Chromatomyia eriodictyi
- Chromatomyia farfarella
- Chromatomyia fricki
- Chromatomyia fuscula
- Chromatomyia gentianae
- Chromatomyia gentianella
- Chromatomyia gentii
- Chromatomyia glacialis
- Chromatomyia gregaria
- Chromatomyia griffithsi
- Chromatomyia hoppiella
- Chromatomyia horticola
- Chromatomyia involucratae
- Chromatomyia isicae
- Chromatomyia lactuca
- Chromatomyia lonicerae
- Chromatomyia luzulae
- Chromatomyia merula
- Chromatomyia milii
- Chromatomyia mimuli
- Chromatomyia nervi
- Chromatomyia nigrella
- Chromatomyia nigrilineata
- Chromatomyia nigrissima
- Chromatomyia nordica
- Chromatomyia norwegica
- Chromatomyia ochracea
- Chromatomyia opacella
- Chromatomyia poae
- Chromatomyia primulae
- Chromatomyia pseudomilii
- Chromatomyia puccinelliae
- Chromatomyia ramosa
- Chromatomyia regalensis
- Chromatomyia saxifragae
- Chromatomyia scabiosae
- Chromatomyia scabiosarum
- Chromatomyia seneciophila
- Chromatomyia soldanellae
- Chromatomyia spenceriana
- Chromatomyia styriaca
- Chromatomyia subnigra
- Chromatomyia succisae
- Chromatomyia symphoricarpi
- Chromatomyia syngenesiae
- Chromatomyia tiarellae
- Chromatomyia tschirnhausi