Scaptomyza aberrans- Scaptomyza abrupta
- Scaptomyza acronastes
- Scaptomyza adunca
- Scaptomyza adusta
- Scaptomyza affinicuspidata
- Scaptomyza albovittata
- Scaptomyza aloha
- Scaptomyza andina
- Scaptomyza anechocerca
- Scaptomyza anomala
- Scaptomyza apicata
- Scaptomyza apicigutulla
- Scaptomyza apponopusilla
- Scaptomyza argentifrons
- Scaptomyza articulata
- Scaptomyza atahualpa
- Scaptomyza basiloba
- Scaptomyza bilobata
- Scaptomyza bipars
- Scaptomyza bipunctipennis
- Scaptomyza biseta
- Scaptomyza bogotae
- Scaptomyza brachycerca
- Scaptomyza brunnimaculata
- Scaptomyza bryani
- Scaptomyza bryanti
- Scaptomyza buccata
- Scaptomyza caliginosa
- Scaptomyza camptochaites
- Scaptomyza cerina
- Scaptomyza chauliodon
- Scaptomyza clavifera
- Scaptomyza cnecosoma
- Scaptomyza concinna
- Scaptomyza confusa
- Scaptomyza connata
- Scaptomyza coquilletti
- Scaptomyza cornuta
- Scaptomyza cryptoloba
- Scaptomyza ctenophora
- Scaptomyza cuspidata
- Scaptomyza cyrtandrae
- Scaptomyza dankoi
- Scaptomyza decepta
- Scaptomyza deludens
- Scaptomyza dentata
- Scaptomyza devexa
- Scaptomyza diaphorocerca
- Scaptomyza domita
- Scaptomyza dubautiae
- Scaptomyza dubia
- Scaptomyza eurystylata
- Scaptomyza evexa
- Scaptomyza fastigata
- Scaptomyza finitima
- Scaptomyza flava
- Scaptomyza flavida
- Scaptomyza flavifacies
- Scaptomyza flaviventris
- Scaptomyza fuscifrons
- Scaptomyza fuscinervis
- Scaptomyza gilvivirilia
- Scaptomyza glauca
- Scaptomyza grahami
- Scaptomyza graminum
- Scaptomyza griseola
- Scaptomyza hackmani
- Scaptomyza hamata
- Scaptomyza hardyi
- Scaptomyza heedi
- Scaptomyza hirsuta
- Scaptomyza hsui
- Scaptomyza inaequalis
- Scaptomyza inermis
- Scaptomyza infurcula
- Scaptomyza innotabilis
- Scaptomyza intricata
- Scaptomyza isopedon
- Scaptomyza kauaiensis
- Scaptomyza latifrons
- Scaptomyza latitergum
- Scaptomyza levata
- Scaptomyza lobifera
- Scaptomyza longipecten
- Scaptomyza longisetosa
- Scaptomyza macroptera
- Scaptomyza malada
- Scaptomyza mecocerca
- Scaptomyza mediana
- Scaptomyza mediopallens
- Scaptomyza mimula
- Scaptomyza mitchelli
- Scaptomyza molokaiensis
- Scaptomyza montana
- Scaptomyza multidenta
- Scaptomyza mumfordi
- Scaptomyza mutica
- Scaptomyza neoandina
- Scaptomyza neoevexa
- Scaptomyza neokauaiensis
- Scaptomyza neosilvicola
- Scaptomyza nigricosta
- Scaptomyza nigripalpis
- Scaptomyza nigrita
- Scaptomyza nigrosignata
- Scaptomyza oahuensis
- Scaptomyza ochromata
- Scaptomyza ostensa
- Scaptomyza palata
- Scaptomyza pallida
- Scaptomyza pallifrons
- Scaptomyza palmae
- Scaptomyza paradusta
- Scaptomyza paralobae
- Scaptomyza parandina
- Scaptomyza paravittata
- Scaptomyza penicula
- Scaptomyza personata
- Scaptomyza photophilia
- Scaptomyza phryxothrix
- Scaptomyza picifemorata
- Scaptomyza platyrhina
- Scaptomyza pleurolineata
- Scaptomyza protensa
- Scaptomyza punctivena
- Scaptomyza quadridentata
- Scaptomyza quadriseriata
- Scaptomyza recava
- Scaptomyza recta
- Scaptomyza retusa
- Scaptomyza robusta
- Scaptomyza rostrata
- Scaptomyza rotundiloba
- Scaptomyza salvadorae
- Scaptomyza samurai
- Scaptomyza scoliops
- Scaptomyza scoloplichas
- Scaptomyza semiflava
- Scaptomyza setiger
- Scaptomyza setosa
- Scaptomyza setosiloba
- Scaptomyza setosiscutellum
- Scaptomyza silvicola
- Scaptomyza spilota
- Scaptomyza stramineifrons
- Scaptomyza striaticeps
- Scaptomyza striatifrons
- Scaptomyza subandina
- Scaptomyza subvittata
- Scaptomyza swezeyi
- Scaptomyza teinoptera
- Scaptomyza tenuata
- Scaptomyza throckmortoni
- Scaptomyza trivittata
- Scaptomyza trochanterata
- Scaptomyza tumidula
- Scaptomyza uliginosa
- Scaptomyza umbrosa
- Scaptomyza unipunctum
- Scaptomyza univitta
- Scaptomyza vagabunda
- Scaptomyza varia
- Scaptomyza varipicta
- Scaptomyza villosa
- Scaptomyza vittata
- Scaptomyza vittiger
- Scaptomyza waialealeae
- Scaptomyza wheeleri
- Scaptomyza xanthopleura