Neognophomyia adara- Neognophomyia bisecta
- Neognophomyia bisetosa
- Neognophomyia citripes
- Neognophomyia cochlearis
- Neognophomyia consociata
- Neognophomyia crassistyla
- Neognophomyia cuzcoensis
- Neognophomyia debilitata
- Neognophomyia heliconiae
- Neognophomyia hostica
- Neognophomyia interrupta
- Neognophomyia monophora
- Neognophomyia obtusilamina
- Neognophomyia panamensis
- Neognophomyia paprzyckiana
- Neognophomyia perluteola
- Neognophomyia pinckerti
- Neognophomyia productissima
- Neognophomyia scapha
- Neognophomyia scaphoides
- Neognophomyia schildi
- Neognophomyia setilobata
- Neognophomyia sparsiseta
- Neognophomyia spectralis
- Neognophomyia spinicauda
- Neognophomyia trinitatis