- Mycomya alexanderi
- Mycomya aneura
- Mycomya annulata
- Mycomya ansata
- Mycomya aristei
- Mycomya basinerva
- Mycomya bequaerti
- Mycomya bicolor
- Mycomya bifida
- Mycomya brevifurcata
- Mycomya calcarata
- Mycomya canoak
- Mycomya cinerascens
- Mycomya cockerelli
- Mycomya comesa
- Mycomya coxalis
- Mycomya cramptoni
- Mycomya cylindrica
- Mycomya danielae
- Mycomya dichaeta
- Mycomya digitifera
- Mycomya diluta
- Mycomya divisa
- Mycomya falcifera
- Mycomya ferrazi
- Mycomya festivalis
- Mycomya fimbriata
- Mycomya flavescens
- Mycomya forcipata
- Mycomya fornicata
- Mycomya funebris
- Mycomya furcata
- Mycomya fuscata
- Mycomya fuscicornis
- Mycomya griseovittata
- Mycomya hansoni
- Mycomya hyalinata
- Mycomya ibex
- Mycomya imitans
- Mycomya incisurata
- Mycomya indica
- Mycomya inermis
- Mycomya infuscata
- Mycomya jaffuelensis
- Mycomya kingi
- Mycomya klossi
- Mycomya kyan
- Mycomya lambi
- Mycomya lamellata
- Mycomya lanei
- Mycomya littoralis
- Mycomya longistila
- Mycomya maculata
- Mycomya manteri
- Mycomya marginata
- Mycomya mathesoni
- Mycomya maura
- Mycomya melania
- Mycomya minutata
- Mycomya montalba
- Mycomya neohyalinata
- Mycomya nigricornis
- Mycomya nitida
- Mycomya occultans
- Mycomya ochracea
- Mycomya onusta
- Mycomya ornata
- Mycomya par
- Mycomya pectinata
- Mycomya penicillata
- Mycomya permixta
- Mycomya peruviana
- Mycomya polleni
- Mycomya portoblest
- Mycomya pulchella
- Mycomya punctata
- Mycomya pygmalion
- Mycomya rebellicosa
- Mycomya rosalba
- Mycomya samesteri
- Mycomya setifera
- Mycomya shannoni
- Mycomya sigma
- Mycomya simillima
- Mycomya simplex
- Mycomya spinifera
- Mycomya spinosa
- Mycomya stares
- Mycomya subfusca
- Mycomya taurus
- Mycomya terminata
- Mycomya trichops
- Mycomya tumida
- Mycomya unicolor
- Mycomya unipectinata
- Mycomya wankowiczii
- Mycomya winnertzi
- Mycomya woodi
- Mycomya yoshimotoi
- Mycomyia fossilis
- Mycomyia kuhni
- Mycomyia reisingeri
- Mycomyia umbonata