- Aphaereta ceratitivora
- Aphaereta colei
- Aphaereta confusa
- Aphaereta dipterica
- Aphaereta excavata
- Aphaereta flavidens
- Aphaereta genevensis
- Aphaereta ithacensis
- Aphaereta major
- Aphaereta marshi
- Aphaereta masoni
- Aphaereta megalops
- Aphaereta muesebecki
- Aphaereta pallipes
- Aphaereta sarcophage
- Aphaereta scaptomyzae
- Aphaereta subtropicalis
- Aphaereta tenuicornis
- Aphaereta varipedis