Kootenia acicularis- Kootenia aculacauda
- Kootenia aldrichensis
- Kootenia austinvillensis
- Kootenia bearensis
- Kootenia brevispina
- Kootenia browni
- Kootenia burgessensis
- Kootenia buttsi
- Kootenia cloudensis
- Kootenia convoluta
- Kootenia crassa
- Kootenia crassinucha
- Kootenia currieri
- Kootenia erromena
- Kootenia exilaxata
- Kootenia fragilis
- Kootenia germana
- Kootenia gracilis
- Kootenia granulosa
- Kootenia granulospinosa
- Kootenia havasuensis
- Kootenia idahoensis
- Kootenia infera
- Kootenia latidorsata
- Kootenia libertyensis
- Kootenia maladensis
- Kootenia mathewsi
- Kootenia mckeei
- Kootenia mendosa
- Kootenia nitida
- Kootenia pariquadriceps
- Kootenia pectenoides
- Kootenia pricei
- Kootenia romensis
- Kootenia rugosa
- Kootenia scapegoatensis
- Kootenia schenki
- Kootenia simplex
- Kootenia spencei
- Kootenia styrax
- Kootenia subequalis
- Kootenia tennesseensis
- Kootenia tetraspinosa
- Kootenia troyensis
- Kootenia varia
- Kootenia venusta
- Kootenia virginiana