Cynodonichthys brunneus- Cynodonichthys chucunaque
- Cynodonichthys elegans
- Cynodonichthys fuscolineatus
- Cynodonichthys glaucus
- Cynodonichthys godmani
- Cynodonichthys hendrichsi
- Cynodonichthys hildebrandi
- Cynodonichthys isthmensis
- Cynodonichthys magdalenae
- Cynodonichthys montium
- Cynodonichthys myersi
- Cynodonichthys pacificus
- Cynodonichthys rubripunctatus
- Cynodonichthys siegfriedi
- Cynodonichthys sucubti
- Cynodonichthys tenuis
- Cynodonichthys uroflammeus
- Cynodonichthys weberi