Miniopterus aelleni- Miniopterus africanus
- Miniopterus ambohitrensis
- Miniopterus australis
- Miniopterus egeri
- Miniopterus fraterculus
- Miniopterus fuscus
- Miniopterus gleni
- Miniopterus griffithsi
- Miniopterus griveaudi
- Miniopterus inflatus
- Miniopterus macrocneme
- Miniopterus magnater
- Miniopterus mahafaliensis
- Miniopterus majori
- Miniopterus manavi
- Miniopterus medius
- Miniopterus minor
- Miniopterus natalensis
- Miniopterus newtoni
- Miniopterus pallidus
- Miniopterus paululus
- Miniopterus petersoni
- Miniopterus pusillus
- Miniopterus robustior
- Miniopterus schreibersii
- Miniopterus scotinus
- Miniopterus shortridgei
- Miniopterus sororculus
- Miniopterus tristis