- Peromyscus attwateri
- Peromyscus aztecus
- Peromyscus baileyi
- Peromyscus banderanus
- Peromyscus beatae
- Peromyscus boylii
- Peromyscus brachygnathus
- Peromyscus bullatus
- Peromyscus californicus
- Peromyscus caniceps
- Peromyscus carletoni
- Peromyscus crinitus
- Peromyscus cumberlandensis
- Peromyscus dickeyi
- Peromyscus difficilis
- Peromyscus eremicus
- Peromyscus fraterculus
- Peromyscus furvus
- Peromyscus gardneri
- Peromyscus gossypinus
- Peromyscus grandis
- Peromyscus gratus
- Peromyscus guardia
- Peromyscus guatemalensis
- Peromyscus gymnotis
- Peromyscus hooperi
- Peromyscus hylocetes
- Peromyscus interparietalis
- Peromyscus keeni
- Peromyscus leucopus
- Peromyscus levipes
- Peromyscus madrensis
- Peromyscus maniculatus
- Peromyscus mayensis
- Peromyscus megalops
- Peromyscus mekisturus
- Peromyscus melanocarpus
- Peromyscus melanophrys
- Peromyscus melanotis
- Peromyscus melanurus
- Peromyscus merriami
- Peromyscus mexicanus
- Peromyscus minimus
- Peromyscus nasutus
- Peromyscus nudipes
- Peromyscus ochraventer
- Peromyscus pectoralis
- Peromyscus pembertoni
- Peromyscus perfulvus
- Peromyscus polionotus
- Peromyscus polius
- Peromyscus pseudocrinitus
- Peromyscus sagax
- Peromyscus sejugis
- Peromyscus simulus
- Peromyscus slevini
- Peromyscus spicilegus
- Peromyscus stephani
- Peromyscus stirtoni
- Peromyscus truei
- Peromyscus winkelmanni
- Peromyscus yucatanicus
- Peromyscus zarhynchus