Parapharyngodon awokoyai- Parapharyngodon baueri
- Parapharyngodon bulbosus
- Parapharyngodon colonensis
- Parapharyngodon duniae
- Parapharyngodon echinatus
- Parapharyngodon grenadaensis
- Parapharyngodon grismeri
- Parapharyngodon guerreroensis
- Parapharyngodon iguanae
- Parapharyngodon japonicus
- Parapharyngodon kenyaensis
- Parapharyngodon micipsae
- Parapharyngodon ocalaensis