Choanotaenia atopa- Choanotaenia barbara
- Choanotaenia cayennensis
- Choanotaenia falsificata
- Choanotaenia fortunata
- Choanotaenia infundibuliformis
- Choanotaenia infundibulum
- Choanotaenia iola
- Choanotaenia littoriae
- Choanotaenia macracantha
- Choanotaenia magnicirrosa
- Choanotaenia megistacantha
- Choanotaenia mollis
- Choanotaenia nebraskensis
- Choanotaenia pauciannulata
- Choanotaenia polyorchis
- Choanotaenia riccii
- Choanotaenia sciuricola
- Choanotaenia soricina
- Choanotaenia speotyonis