- Brachionus angularis
- Brachionus araceliae
- Brachionus bidentatus
- Brachionus budapestinensis
- Brachionus calyciflorus
- Brachionus caudatus
- Brachionus dichotomus
- Brachionus dimidiatus
- Brachionus diversicornis
- Brachionus dolabratus
- Brachionus falcatus
- Brachionus havanaensis
- Brachionus ibericus
- Brachionus leydigii
- Brachionus mirabilis
- Brachionus mirus
- Brachionus novaezealandiae
- Brachionus plicatilis
- Brachionus pterodinoides
- Brachionus quadridentatus
- Brachionus rotundiformis
- Brachionus rubens
- Brachionus satanicus
- Brachionus sericus
- Brachionus urceolaris
- Brachionus variabilis
- Brachionus zahniseri