Aphanothece caldariorum- Aphanothece castagnei
- Aphanothece clathrata
- Aphanothece coerulescens
- Aphanothece conferta
- Aphanothece conglomerata
- Aphanothece gelatinosa
- Aphanothece heterospora
- Aphanothece microscopica
- Aphanothece microspora
- Aphanothece naegeli
- Aphanothece nidulans
- Aphanothece pallida
- Aphanothece saxicola
- Aphanothece utahensis