Lyngbya aerugineo-caerulea- Lyngbya aeruginosa
- Lyngbya aestuarii
- Lyngbya amphibia
- Lyngbya antliaria
- Lyngbya arachnoidea
- Lyngbya atropurpurea
- Lyngbya atrovirens
- Lyngbya attenuata
- Lyngbya bicolor
- Lyngbya bipunctata
- Lyngbya birgei
- Lyngbya bornetii
- Lyngbya bosniaca
- Lyngbya bugellensis
- Lyngbya calcicola
- Lyngbya calida
- Lyngbya catenellae
- Lyngbya chalybea
- Lyngbya chungii
- Lyngbya cilicium
- Lyngbya cinerascens
- Lyngbya circumcrete
- Lyngbya cladophorae
- Lyngbya complectens
- Lyngbya confervoides
- Lyngbya conglutinata
- Lyngbya constricta
- Lyngbya contexta
- Lyngbya contorta
- Lyngbya crassa
- Lyngbya dendrobia
- Lyngbya diguetii
- Lyngbya drouetii
- Lyngbya effusa
- Lyngbya elegans
- Lyngbya elongata
- Lyngbya epiphytica
- Lyngbya epizooica
- Lyngbya erebii
- Lyngbya fallax
- Lyngbya ferruginea
- Lyngbya flocculosa
- Lyngbya froehlichii
- Lyngbya fulva
- Lyngbya fuscata
- Lyngbya galaxaurae
- Lyngbya giuseppei
- Lyngbya gracilis
- Lyngbya gracillima
- Lyngbya guaymensis
- Lyngbya guianensis
- Lyngbya hahatonkensis
- Lyngbya halophila
- Lyngbya hamelii
- Lyngbya hieronymusii
- Lyngbya hummellii
- Lyngbya interrupta
- Lyngbya investiens
- Lyngbya joanniana
- Lyngbya juliana
- Lyngbya kuetzingiana
- Lyngbya kuetzingii
- Lyngbya lateritia
- Lyngbya latissima
- Lyngbya laxespiralis
- Lyngbya limnetica
- Lyngbya lismorensis
- Lyngbya litorea
- Lyngbya livida
- Lyngbya longearticulata
- Lyngbya lutea
- Lyngbya luteofusca
- Lyngbya lutescens
- Lyngbya magnifica
- Lyngbya major
- Lyngbya majuscula
- Lyngbya mandruzzatiana
- Lyngbya margaritacea
- Lyngbya martensiana
- Lyngbya meneghiniana
- Lyngbya mesotricha
- Lyngbya mexiensis
- Lyngbya microscopica
- Lyngbya miniata
- Lyngbya minor
- Lyngbya minuta
- Lyngbya mittsii
- Lyngbya muscicola
- Lyngbya nana
- Lyngbya nigra
- Lyngbya nigrescens
- Lyngbya nigrovaginata
- Lyngbya nordgaardii
- Lyngbya noronhae
- Lyngbya obscura
- Lyngbya ochracea
- Lyngbya ocreata
- Lyngbya olivacea
- Lyngbya pacifica
- Lyngbya pallida
- Lyngbya pannosa
- Lyngbya patrickiana
- Lyngbya pellucida
- Lyngbya penicillata
- Lyngbya perelegans
- Lyngbya phormidium
- Lyngbya plana
- Lyngbya profundalis
- Lyngbya purpurea
- Lyngbya pusilla
- Lyngbya putealis
- Lyngbya regeliana
- Lyngbya rimosa
- Lyngbya rivulariarum
- Lyngbya roseola
- Lyngbya rupicola
- Lyngbya schowiana
- Lyngbya schroeteri
- Lyngbya scottii
- Lyngbya scytonematoides
- Lyngbya semiplena
- Lyngbya shackeltonii
- Lyngbya sinuosa
- Lyngbya solitaris
- Lyngbya sordida
- Lyngbya spirulinoides
- Lyngbya splendens
- Lyngbya stagnina
- Lyngbya stragulum
- Lyngbya subaestuarii
- Lyngbya subconfervoides
- Lyngbya subcyanea
- Lyngbya subolivacea
- Lyngbya subtilis
- Lyngbya taylori
- Lyngbya terrestris
- Lyngbya thalassiae
- Lyngbya thermalis
- Lyngbya thornensis
- Lyngbya tomentosa
- Lyngbya tropica
- Lyngbya usterii
- Lyngbya versatilis
- Lyngbya versicolor
- Lyngbya wollei