Calothrix adscendens- Calothrix aequalis
- Calothrix aeruginea
- Calothrix aeruginosa
- Calothrix agardhii
- Calothrix anomala
- Calothrix baueriana
- Calothrix braunii
- Calothrix breviarticulata
- Calothrix caespitora
- Calothrix cesatii
- Calothrix confervicola
- Calothrix conica
- Calothrix contareni
- Calothrix cresswellii
- Calothrix crustacea
- Calothrix crustaceae
- Calothrix denotaris
- Calothrix epiphytica
- Calothrix evanescens
- Calothrix fasciculata
- Calothrix fusca
- Calothrix fusco-violacea
- Calothrix gypsophila
- Calothrix jantiphora
- Calothrix limbata
- Calothrix longifila
- Calothrix micromeres
- Calothrix parasitica
- Calothrix parietina
- Calothrix pilosa
- Calothrix pulvinata
- Calothrix radiosa
- Calothrix rectangularis
- Calothrix rhizomatoidea
- Calothrix robusta
- Calothrix rupestris
- Calothrix scopulorum
- Calothrix scytonemicola
- Calothrix simplex
- Calothrix simulans
- Calothrix solitaria
- Calothrix stagnalis
- Calothrix stellaris
- Calothrix symplocoides
- Calothrix synplocoides
- Calothrix tenella
- Calothrix thermalis
- Calothrix tomasinii
- Calothrix vivipara