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- Achnanthales
- Anaulales
- Arachnoidiscales
- Ardissoneales
- Asterolamprales
- Aulacoseirales
- Bacillariales
- Biddulphiales
- Centrales
- Chaetocerotales
- Climacospheniales
- Corethrales
- Coscinodiscales
- Cyclophorales
- Cymatosirales
- Cymbellales
- Dictyoneidales
- Ethmodiscales
- Eunotiales
- Fragilariales
- Hemiaulales
- Leptocylindrales
- Licmophorales
- Lithodesmiales
- Lyrellales
- Mastogloiales
- Melosirales
- Naviculales
- Orthoseirales
- Paraliales
- Protoraphidales
- Rhabdonematales
- Rhaponeidales
- Rhizosoleniales
- Rhopalodiales
- Stictocyclales
- Stictodiscales
- Striatellales
- Surirellales
- Tabellariales
- Thalassionematales
- Thalassiophysales
- Thalassiosirales
- Toxariales
- Triceratiales