Septoria acerella- Septoria acericola
- Septoria acerina
- Septoria aceris-macrophylli
- Septoria acetosa
- Septoria aciculosa
- Septoria acruriana
- Septoria adenocauli
- Septoria aegirina
- Septoria aegopodii
- Septoria aesculi
- Septoria aetheorrhizae
- Septoria agrimoniae-eupatoriae
- Septoria agropyri
- Septoria agropyrina
- Septoria agrostidis
- Septoria ahmadii
- Septoria aitchisonii
- Septoria alba
- Septoria albanica
- Septoria albaniensis
- Septoria albonigra
- Septoria albopunctata
- Septoria allardii
- Septoria allescheri
- Septoria alni
- Septoria alnifolia
- Septoria alopecuri-agrestis
- Septoria alpicola
- Septoria altajensis
- Septoria althaeae
- Septoria alyssi
- Septoria ammophilae
- Septoria ampelina
- Septoria anarrhina
- Septoria anchusae
- Septoria andropogonis
- Septoria anemones
- Septoria angularis
- Septoria angustifolia
- Septoria annua
- Septoria anodae
- Septoria antirrhini
- Septoria antirrhinorum
- Septoria aparines
- Septoria apatela
- Septoria apetalae
- Septoria aphaniae
- Septoria apii
- Septoria apiicola
- Septoria arabidis
- Septoria araguata
- Septoria araliae
- Septoria arechavaletae
- Septoria argemones
- Septoria argophyllae
- Septoria armeriae
- Septoria arnoseridis
- Septoria aromatica
- Septoria artemisiae
- Septoria asclepiadicola
- Septoria ascophylli
- Septoria asiaticae
- Septoria asperulae
- Septoria asphodelines
- Septoria asplenii
- Septoria astericola
- Septoria asterina
- Septoria astragali
- Septoria atropurpurea
- Septoria aucupariae
- Septoria aurea
- Septoria bacilligera
- Septoria bakeri
- Septoria baptisiae
- Septoria bataticola
- Septoria bellidicola
- Septoria berteroae
- Septoria betae
- Septoria betulae-odoratae
- Septoria betulicola
- Septoria bidentis
- Septoria bolivarii
- Septoria bonanseana
- Septoria bondarzewii
- Septoria bornmuelleri
- Septoria brassicae
- Septoria brencklei
- Septoria bresadolana
- Septoria brissaceana
- Septoria bromi
- Septoria brunellae
- Septoria bumeliae
- Septoria buphthalmi
- Septoria bupleuri-falcati
- Septoria butleri
- Septoria bygdoensis
- Septoria cacaliae
- Septoria cacticola
- Septoria calamagrostidis
- Septoria calami
- Septoria calamovilfae
- Septoria callae
- Septoria calycicola
- Septoria calystegiae
- Septoria canadensis
- Septoria canavaliae
- Septoria cannabis
- Septoria cardamines-trifoliae
- Septoria cardaminis
- Septoria cardunculii
- Septoria caricinella
- Septoria caricis-montanae
- Septoria caricis-muricatae
- Septoria caricis-piluliferae
- Septoria carnea
- Septoria carpogena
- Septoria carrubi
- Septoria carthami
- Septoria caryae
- Septoria cassiicola
- Septoria cattanei
- Septoria celanensis
- Septoria centaureicola
- Septoria centellae
- Septoria cerastii
- Septoria cerealis
- Septoria chaerophylli-aromatici
- Septoria chaerophylli
- Septoria chamaecysti
- Septoria cheiranthi
- Septoria chelidonii
- Septoria chimaphilae
- Septoria chrysamphorae
- Septoria chrysanthemella
- Septoria chrysanthemi
- Septoria ciferriana
- Septoria circinata
- Septoria cirrosae
- Septoria cirsii-heterophylli
- Septoria cirsii
- Septoria cissicola
- Septoria citri
- Septoria citrulli
- Septoria clematidis
- Septoria clermontiae
- Septoria cocoina
- Septoria codonorchidis
- Septoria collivaga
- Septoria commonsii
- Septoria conigena
- Septoria consimilis
- Septoria conspicua
- Septoria convolvuli
- Septoria conyzae
- Septoria coptidis
- Septoria corcontica
- Septoria cordiae
- Septoria coriaricola
- Septoria corni-controversae
- Septoria cornina
- Septoria corockeae
- Septoria corollae
- Septoria corylina
- Septoria corynocarpi
- Septoria cotylea
- Septoria crataegi
- Septoria crawfurdiae
- Septoria crepidicola
- Septoria crepidis
- Septoria crotonis
- Septoria cruciatae
- Septoria cryptotaeniae
- Septoria cucurbitacearum
- Septoria culmifida
- Septoria cumulata
- Septoria cunillae
- Septoria curvispora
- Septoria cynodontis
- Septoria cyperi
- Septoria cyrtophylli
- Septoria dalibardae
- Septoria dalmatica
- Septoria dearnessii
- Septoria debauxii
- Septoria debeaunii
- Septoria delphinella
- Septoria dentariae
- Septoria deutziae
- Septoria didyma
- Septoria diedickei
- Septoria diervillae
- Septoria digitalis
- Septoria dipsaci
- Septoria divaricata
- Septoria divaricatae
- Septoria divergens
- Septoria diversimaculans
- Septoria doehlii
- Septoria dolichospora
- Septoria dominii
- Septoria drummondii
- Septoria drygalskii
- Septoria dryina
- Septoria dulcamarae
- Septoria ebuli
- Septoria echinocystis
- Septoria echitis
- Septoria ecuadorensis
- Septoria ekmaniana
- Septoria elaeodendri
- Septoria elaeospora
- Septoria elasticae
- Septoria elymi-europaei
- Septoria elymi
- Septoria endiviae
- Septoria endlicherae
- Septoria epicarpii
- Septoria epigejos
- Septoria epilobii
- Septoria erechtites
- Septoria erechtitis
- Septoria erigerontis
- Septoria erythronii
- Septoria erythrophlaei
- Septoria eugenicola
- Septoria euonymella
- Septoria euonymi-japonicae
- Septoria euonymi
- Septoria eupatorii
- Septoria eupatoriicola
- Septoria eupyrenoides
- Septoria euryae
- Septoria evansii
- Septoria exotica
- Septoria expansa
- Septoria fagi
- Septoria fairmanii
- Septoria ferulina
- Septoria festucae
- Septoria festucina
- Septoria ficariae
- Septoria ficarioides
- Septoria fimbristylidis
- Septoria flagellaris
- Septoria flagellifera
- Septoria flammulae
- Septoria flavescens
- Septoria floridae
- Septoria fragariae
- Septoria fraxinicola
- Septoria fuchsiae
- Septoria fuchsiicola
- Septoria fulvescens
- Septoria fuscomaculans
- Septoria gaillardiae
- Septoria galeobdoli
- Septoria galeopsidis
- Septoria galii-borealis
- Septoria galii
- Septoria galiorum
- Septoria gallarum
- Septoria gandulphi
- Septoria gaurina
- Septoria gerberae
- Septoria gigaspora
- Septoria glabra
- Septoria glabrae
- Septoria gladioli
- Septoria glaucis
- Septoria glycines
- Septoria glycyrrhizae
- Septoria gomphocarpi
- Septoria gomphrenae
- Septoria gonolobicola
- Septoria gouldiae
- Septoria gracilis
- Septoria gregaria
- Septoria greschikii
- Septoria grindeliae
- Septoria guatteriae
- Septoria guettardae
- Septoria gummigena
- Septoria gymnosporiae
- Septoria halleriae
- Septoria hariotiana
- Septoria hederae
- Septoria hedericola
- Septoria helianthi
- Septoria helichrysi
- Septoria heliopsidis
- Septoria hellebori
- Septoria hennigsiana
- Septoria henriquesii
- Septoria hepaticae
- Septoria hepaticicola
- Septoria heterochroa
- Septoria hicoriae
- Septoria hippophaes
- Septoria hordei
- Septoria hortensis
- Septoria hu
- Septoria humuli
- Septoria hyalina
- Septoria hydrocotyles
- Septoria hydrophylli
- Septoria ilicifolia
- Septoria incarnata
- Septoria increscens
- Septoria infuscata
- Septoria intermedia
- Septoria iridis
- Septoria jaapii
- Septoria jackmani
- Septoria jaculella
- Septoria jatrophae
- Septoria jenisseica
- Septoria jenissensis
- Septoria jussiaeae
- Septoria kalchbrenneri
- Septoria karelli
- Septoria kerriae
- Septoria kitaibeliae
- Septoria kriegeriana
- Septoria lablabina
- Septoria lablabis
- Septoria lactucae
- Septoria lactucicola
- Septoria lacustris
- Septoria lamii
- Septoria lamiicola
- Septoria lantanae
- Septoria lapadensis
- Septoria lapparum
- Septoria lardizabalae
- Septoria lathyri
- Septoria laurocerasi
- Septoria leguminum
- Septoria lepachidis
- Septoria lepidiicola
- Septoria leptostachya
- Septoria leucanthemi
- Septoria leucostoma
- Septoria liatridis
- Septoria ligustrina
- Septoria linariae
- Septoria lineolata
- Septoria linnaeae
- Septoria liquidambaris
- Septoria lisianthi
- Septoria littorea
- Septoria lobeliae-syphiliticae
- Septoria lobeliae
- Septoria lonicerae
- Septoria lophanthi
- Septoria ludoviciana
- Septoria ludwigii
- Septoria lunariae
- Septoria lupini
- Septoria lupiniphila
- Septoria lupulina
- Septoria lycoctoni
- Septoria lycopersici
- Septoria lycopi
- Septoria lycopodina
- Septoria lysimachiae
- Septoria lythrina
- Septoria macropoda
- Septoria macrosporia
- Septoria macrostoma
- Septoria maculans
- Septoria magnusiana
- Septoria malvicola
- Septoria mandevillae
- Septoria maqui
- Septoria marginata
- Septoria marmorata
- Septoria martianoffiana
- Septoria matricariae
- Septoria matthiolae
- Septoria megarrhizae
- Septoria melandrii
- Septoria meliae
- Septoria melianthi
- Septoria melicae
- Septoria melissae
- Septoria menthae
- Septoria mentzeliae
- Septoria menyanthis
- Septoria micropuncta
- Septoria microsora
- Septoria microspora
- Septoria mimuli
- Septoria mitellae
- Septoria moelleriana
- Septoria moliniae
- Septoria monninae
- Septoria moricola
- Septoria mougeotii
- Septoria mulgedii
- Septoria munroae
- Septoria myriactidis
- Septoria myricae
- Septoria nabali
- Septoria nambuana
- Septoria neglecta
- Septoria negundinis
- Septoria nepetae
- Septoria nesodes
- Septoria nicotianae
- Septoria noctiflorae
- Septoria noli-tangere
- Septoria noranteae
- Septoria obesa
- Septoria obesispora
- Septoria obscura
- Septoria ochraceomaculans
- Septoria oenotherae
- Septoria ophiopogonis
- Septoria orchidearum
- Septoria origanicola
- Septoria orni
- Septoria ornithogali
- Septoria osmorrhizae
- Septoria ostryae
- Septoria oxalidis
- Septoria pachyspora
- Septoria pacifica
- Septoria padi
- Septoria paeoniae
- Septoria paludosa
- Septoria parietariae
- Septoria paspali
- Septoria pauper
- Septoria paupera
- Septoria pavgii
- Septoria pelargonii
- Septoria pentandrina
- Septoria pentastemonicola
- Septoria pentstemonicola
- Septoria peregrina
- Septoria pertusa
- Septoria petitiae
- Septoria petroselini
- Septoria philadelphi
- Septoria phillyreae
- Septoria phlogis
- Septoria physostegiae
- Septoria phyteumatis
- Septoria pileae
- Septoria pisi
- Septoria pistaciae
- Septoria pitcairniae
- Septoria pittieriana
- Septoria pityrogrammae
- Septoria plantaginea
- Septoria plantaginis-majoris
- Septoria platycodontis
- Septoria poae-annuae
- Septoria poae-trivialis
- Septoria podocarpi
- Septoria podophyllina
- Septoria polaris
- Septoria polemonii
- Septoria polemoniicola
- Septoria polygonati
- Septoria polygoni
- Septoria polygonina
- Septoria polygonorum
- Septoria polymniae
- Septoria poseyi
- Septoria posoniensis
- Septoria potentillica
- Septoria prenanthis
- Septoria prunellae
- Septoria pruni
- Septoria pseudacaciae
- Septoria pseudopezizoides
- Septoria pseudoquinae
- Septoria ptarmicae
- Septoria pteleae
- Septoria purpurascens
- Septoria purpureocincta
- Septoria pyrethri
- Septoria pyrolae
- Septoria querceti
- Septoria quercicola
- Septoria quercina
- Septoria quercus
- Septoria quevellensis
- Septoria radiculae
- Septoria rajkoffi
- Septoria ramonensis
- Septoria ravenelii
- Septoria rechingeri
- Septoria recurvata
- Septoria rhabdocarpa
- Septoria rhabdosporioides
- Septoria rhapontici
- Septoria rhizoides
- Septoria rhoina
- Septoria ribis-alpini
- Septoria rollandiae
- Septoria romana
- Septoria rudbeckiae
- Septoria rumicis
- Septoria saccardiana
- Septoria saccharina
- Septoria saccharini
- Septoria salicis
- Septoria salviae-pratensis
- Septoria salviae
- Septoria samarae-aceris
- Septoria samarae-macrophylli
- Septoria samarae
- Septoria sambucina
- Septoria sanguinea
- Septoria saussureae
- Septoria scabiosicola
- Septoria schirajewskii
- Septoria schizeilematis
- Septoria schlechteriana
- Septoria schnabliana
- Septoria scleranthi
- Septoria scorodoniae
- Septoria scrophulariae
- Septoria scutellariae
- Septoria secalis
- Septoria senecionis-silvaticae
- Septoria senecionis-silvatici
- Septoria serbica
- Septoria serpentaria
- Septoria shastensis
- Septoria sicyi
- Septoria sigmoidea
- Septoria signalensis
- Septoria sii
- Septoria silenes
- Septoria silenicola
- Septoria sileris
- Septoria siliquastri
- Septoria silphii
- Septoria simillima
- Septoria siphocampyli
- Septoria sisymbrii
- Septoria sleumeri
- Septoria smilacinae
- Septoria smilacis
- Septoria smilicis
- Septoria sojae
- Septoria solanicola
- Septoria solidaginicola
- Septoria solidaginis
- Septoria solitaria
- Septoria sonchifolia
- Septoria sorbi-hybridae
- Septoria sparganii
- Septoria sparsa
- Septoria speculariae
- Septoria sphaerelloides
- Septoria spiculosa
- Septoria spigeliae
- Septoria spinaciae
- Septoria spraguei
- Septoria stachydis
- Septoria stellariae-nemorosae
- Septoria stellariae
- Septoria stenactidis
- Septoria stenosiphonis
- Septoria stipina
- Septoria stipularis
- Septoria straussiana
- Septoria streptopodis
- Septoria submaculata
- Septoria succisicola
- Septoria sydowiana
- Septoria sydowii
- Septoria symphoricarpi
- Septoria symploci
- Septoria syriacae
- Septoria tabacina
- Septoria tandilensis
- Septoria taraxaci
- Septoria taraxacicola
- Septoria tatarica
- Septoria tecomae
- Septoria tenella
- Septoria tenuissima
- Septoria teucrii
- Septoria thalictri
- Septoria thelygoni
- Septoria thuemenii
- Septoria thysselini
- Septoria torilicola
- Septoria tormentillae
- Septoria tovarensis
- Septoria toxicodendri
- Septoria tradescantiae
- Septoria tramtvetteriae
- Septoria trautvetteriae
- Septoria trientalis
- Septoria trifolii
- Septoria trillii
- Septoria tritici
- Septoria trollii
- Septoria tungurahuana
- Septoria tunicae
- Septoria ucrainica
- Septoria ulmariae
- Septoria ulmi
- Septoria umatillensis
- Septoria umbelliferarum
- Septoria umbilicaris
- Septoria unicolor
- Septoria urens
- Septoria urgineae
- Septoria urticae
- Septoria urticaria
- Septoria uzbekistanica
- Septoria vaccinii
- Septoria valerianellae
- Septoria vallisumbrosae
- Septoria vanhoffenii
- Septoria variegata
- Septoria verbascicola
- Septoria verbenae
- Septoria vernoniae
- Septoria veronicae
- Septoria vestergreniana
- Septoria viciae
- Septoria vicoae
- Septoria vignae
- Septoria villarsiae
- Septoria vincae
- Septoria vindobonensis
- Septoria violae-palustris
- Septoria violae
- Septoria virgaureae
- Septoria viticellae
- Septoria vitis
- Septoria vulcani
- Septoria waldsteiniae
- Septoria weigeliae
- Septoria weissii
- Septoria winteri
- Septoria wistariae
- Septoria xanthifolia
- Septoria xylostei
- Septoria zimmermanni-hugonis
- Septoria zygophylli