Microthyrium abnorme- Microthyrium acervatum
- Microthyrium albigenum
- Microthyrium amygdalinum
- Microthyrium angelica
- Microthyrium annuliforme
- Microthyrium applanatum
- Microthyrium arcticum
- Microthyrium cantareirense
- Microthyrium carludovicae
- Microthyrium coffeae
- Microthyrium concatenatum
- Microthyrium crassum
- Microthyrium cylise
- Microthyrium cytisi
- Microthyrium disjunctum
- Microthyrium ekmanii
- Microthyrium elatum
- Microthyrium eucalypti
- Microthyrium exarescens
- Microthyrium fagi
- Microthyrium grammatophylli
- Microthyrium harrimannii
- Microthyrium holmiae
- Microthyrium idaeum
- Microthyrium ilicinum
- Microthyrium imperatae
- Microthyrium lauraceae
- Microthyrium laurentii
- Microthyrium leopoldvilleanum
- Microthyrium macrosporum
- Microthyrium mbelense
- Microthyrium melaleucae
- Microthyrium microscopicum
- Microthyrium minutissimum
- Microthyrium mischocarpi
- Microthyrium moravicum
- Microthyrium nebulosum
- Microthyrium olivaceum
- Microthyrium pamelae
- Microthyrium pinophyllum
- Microthyrium platani
- Microthyrium pyrenaicum
- Microthyrium quercus
- Microthyrium rimulosum
- Microthyrium rubi
- Microthyrium styracis
- Microthyrium thujae
- Microthyrium urbani
- Microthyrium uvariae
- Microthyrium versicolor