- Elsinoe amazonica
- Elsinoe ampelina
- Elsinoe annonae
- Elsinoe antiaridis
- Elsinoe antidesmae
- Elsinoe aristolochiae
- Elsinoe arrudai
- Elsinoe australis
- Elsinoe baphiae
- Elsinoe basellae
- Elsinoe batatas
- Elsinoe bertholletiae
- Elsinoe bitancourtiana
- Elsinoe blechni
- Elsinoe boucheae
- Elsinoe brasiliensis
- Elsinoe caleae
- Elsinoe calopogonii
- Elsinoe canavaliae
- Elsinoe caroli
- Elsinoe centrolobii
- Elsinoe chandleri
- Elsinoe chilensis
- Elsinoe cinchonae
- Elsinoe cinnamomi
- Elsinoe cissi
- Elsinoe clethrae
- Elsinoe corni
- Elsinoe costai
- Elsinoe crossopterygis
- Elsinoe deslandesii
- Elsinoe fawcettii
- Elsinoe guianensis
- Elsinoe hansfordii
- Elsinoe ilicis
- Elsinoe ledi
- Elsinoe lepagei
- Elsinoe leucospila
- Elsinoe lovoae
- Elsinoe magnoliae
- Elsinoe mangiferae
- Elsinoe mayaguensis
- Elsinoe menispermacearum
- Elsinoe miconiae
- Elsinoe mulleri
- Elsinoe panici
- Elsinoe phaseoli
- Elsinoe piperis
- Elsinoe pitangae
- Elsinoe pritzeliana
- Elsinoe pruni
- Elsinoe puertoricensis
- Elsinoe pyri
- Elsinoe quercus-falcatae
- Elsinoe ractii
- Elsinoe randii
- Elsinoe rochalimai
- Elsinoe rosarum
- Elsinoe sacchari
- Elsinoe salaciae
- Elsinoe sesbaniae
- Elsinoe solidaginis
- Elsinoe spondiadis
- Elsinoe talisiae
- Elsinoe tephrosiae
- Elsinoe theae
- Elsinoe tiliae
- Elsinoe tristaniae
- Elsinoe vaccinii
- Elsinoe veneta
- Elsinoe venezuelensis
- Elsinoe verbenae
- Elsinoe viticola