Coniothyrium arctostaphyli- Coniothyrium astragalinum
- Coniothyrium atriplicinum
- Coniothyrium bambusae
- Coniothyrium baptisiae
- Coniothyrium bartholomaei
- Coniothyrium berberidis
- Coniothyrium bupleuri
- Coniothyrium ceibae
- Coniothyrium clandestinum
- Coniothyrium coffeae
- Coniothyrium comari
- Coniothyrium concentricum
- Coniothyrium conicola
- Coniothyrium connari
- Coniothyrium conoideum
- Coniothyrium conorum
- Coniothyrium coptospermae
- Coniothyrium cytisellum
- Coniothyrium cytisi
- Coniothyrium discincola
- Coniothyrium equiseti
- Coniothyrium eriogoni
- Coniothyrium fuscidulum
- Coniothyrium gallicola
- Coniothyrium glomerulatum
- Coniothyrium grossulariae
- Coniothyrium hariotianum
- Coniothyrium henriquesii
- Coniothyrium herbarum
- Coniothyrium herraniae
- Coniothyrium hyperici
- Coniothyrium infuscans
- Coniothyrium insitivum
- Coniothyrium inulae
- Coniothyrium kochiae
- Coniothyrium laburnophilum
- Coniothyrium lecanoracearum
- Coniothyrium leguminis
- Coniothyrium leguminum
- Coniothyrium lespedezae
- Coniothyrium leucothoes
- Coniothyrium lupulinum
- Coniothyrium maderense
- Coniothyrium marrubii
- Coniothyrium massariae
- Coniothyrium melanconieum
- Coniothyrium minus
- Coniothyrium montagnei
- Coniothyrium obiones
- Coniothyrium olivaceum
- Coniothyrium olympicum
- Coniothyrium orbicula
- Coniothyrium orni
- Coniothyrium oroxyli
- Coniothyrium oryzae
- Coniothyrium paeoniae
- Coniothyrium palmarum
- Coniothyrium palmicola
- Coniothyrium palmigenum
- Coniothyrium parasitans
- Coniothyrium paulense
- Coniothyrium pelargonii
- Coniothyrium pentastemonis
- Coniothyrium pentstemonis
- Coniothyrium populi
- Coniothyrium rechingeri
- Coniothyrium rhododendri
- Coniothyrium rhois
- Coniothyrium ribis
- Coniothyrium rupicola
- Coniothyrium sambuci
- Coniothyrium sarothamni
- Coniothyrium scirpi
- Coniothyrium scopariicola
- Coniothyrium sphaerospermum
- Coniothyrium stanhopeae
- Coniothyrium subradicale
- Coniothyrium sydowianum
- Coniothyrium tamaricellum
- Coniothyrium tamaricis
- Coniothyrium tamarisci
- Coniothyrium tenue
- Coniothyrium tirolense
- Coniothyrium truncisedum
- Coniothyrium ucrainicum
- Coniothyrium ulmi
- Coniothyrium valsoideum
- Coniothyrium vochysiae
- Coniothyrium wernsdorffiae
- Coniothyrium xanthorroeae