- Chaenothecopsis amurensis
- Chaenothecopsis arthoniae
- Chaenothecopsis asperopoda
- Chaenothecopsis australis
- Chaenothecopsis brevipes
- Chaenothecopsis consociata
- Chaenothecopsis debilis
- Chaenothecopsis dolichocephala
- Chaenothecopsis epithallina
- Chaenothecopsis exilis
- Chaenothecopsis golubkovae
- Chaenothecopsis haematopus
- Chaenothecopsis hospitans
- Chaenothecopsis irregularis
- Chaenothecopsis kalbii
- Chaenothecopsis lecanactidis
- Chaenothecopsis montana
- Chaenothecopsis nana
- Chaenothecopsis nigra
- Chaenothecopsis nigripunctata
- Chaenothecopsis nigropedata
- Chaenothecopsis nivea
- Chaenothecopsis norstictica
- Chaenothecopsis ochroleuca
- Chaenothecopsis oregana
- Chaenothecopsis parasitaster
- Chaenothecopsis pilosa
- Chaenothecopsis pilosae
- Chaenothecopsis pusilla
- Chaenothecopsis pusiola
- Chaenothecopsis rubescens
- Chaenothecopsis rubina
- Chaenothecopsis sagenidii
- Chaenothecopsis sanguinea
- Chaenothecopsis savonica
- Chaenothecopsis savonnia
- Chaenothecopsis schefflerae
- Chaenothecopsis servitii
- Chaenothecopsis subparoica
- Chaenothecopsis tasmanica
- Chaenothecopsis thujae
- Chaenothecopsis trassii
- Chaenothecopsis tsugae
- Chaenothecopsis ussuriensis
- Chaenothecopsis vainioana
- Chaenothecopsis viridialba
- Chaenothecopsis viridireagens