- Baeomyces aggregatus
- Baeomyces botryophorus
- Baeomyces brevis
- Baeomyces callianthus
- Baeomyces carneus
- Baeomyces chilensis
- Baeomyces crenulatus
- Baeomyces cupreus
- Baeomyces haemotropus
- Baeomyces heteromorphus
- Baeomyces jamesonii
- Baeomyces marginalis
- Baeomyces pachypus
- Baeomyces pertenuis
- Baeomyces placophyllus
- Baeomyces puiggarii
- Baeomyces rhodochrous
- Baeomyces rufus
- Baeomyces sanguineus
- Baeomyces skottsbergii
- Baeomyces trachypus
- Baeomyces uncialis