- Pyrenopeziza absinthii
- Pyrenopeziza adenostylidis
- Pyrenopeziza agrimoniae
- Pyrenopeziza alismatis
- Pyrenopeziza ampelina
- Pyrenopeziza angelicae
- Pyrenopeziza araliae
- Pyrenopeziza arctata
- Pyrenopeziza arctii
- Pyrenopeziza arenivaga
- Pyrenopeziza arnoldiana
- Pyrenopeziza artemisiae
- Pyrenopeziza arundinacea
- Pyrenopeziza atrata
- Pyrenopeziza aureola
- Pyrenopeziza austriaca
- Pyrenopeziza baraliana
- Pyrenopeziza benesuada
- Pyrenopeziza betulina
- Pyrenopeziza brassicae
- Pyrenopeziza bubakii
- Pyrenopeziza californica
- Pyrenopeziza capsulicola
- Pyrenopeziza carduorum
- Pyrenopeziza cariosa
- Pyrenopeziza carniolica
- Pyrenopeziza cervinula
- Pyrenopeziza chailletii
- Pyrenopeziza chamaenerii
- Pyrenopeziza coloradensis
- Pyrenopeziza commoda
- Pyrenopeziza compressula
- Pyrenopeziza coriariae
- Pyrenopeziza cotoneastri
- Pyrenopeziza crenatocostata
- Pyrenopeziza dearnessii
- Pyrenopeziza dermatoides
- Pyrenopeziza diffindens
- Pyrenopeziza digitalina
- Pyrenopeziza distinguenda
- Pyrenopeziza doryphora
- Pyrenopeziza ebuli
- Pyrenopeziza ebulicola
- Pyrenopeziza ellisii
- Pyrenopeziza emergens
- Pyrenopeziza eryngii
- Pyrenopeziza fimbriata
- Pyrenopeziza foliicola
- Pyrenopeziza fuckelii
- Pyrenopeziza fuscescens
- Pyrenopeziza galii-veri
- Pyrenopeziza galii
- Pyrenopeziza gentianae-asclepiadeae
- Pyrenopeziza gentianae
- Pyrenopeziza gnaphaliana
- Pyrenopeziza griseoalbida
- Pyrenopeziza heteromelis
- Pyrenopeziza huetteri
- Pyrenopeziza hysterina
- Pyrenopeziza inornata
- Pyrenopeziza iridis
- Pyrenopeziza islebiensis
- Pyrenopeziza karstenii
- Pyrenopeziza knautiae
- Pyrenopeziza kriegeriana
- Pyrenopeziza labrosa
- Pyrenopeziza lacerata
- Pyrenopeziza laricina
- Pyrenopeziza lavaterae
- Pyrenopeziza lettaui
- Pyrenopeziza leucodermis
- Pyrenopeziza leucostoma
- Pyrenopeziza lini
- Pyrenopeziza lojkae
- Pyrenopeziza lonicera
- Pyrenopeziza lonicerae
- Pyrenopeziza lychnidis
- Pyrenopeziza lycopincola
- Pyrenopeziza maculans
- Pyrenopeziza mercurialis
- Pyrenopeziza millegrana
- Pyrenopeziza millepunctata
- Pyrenopeziza minuta
- Pyrenopeziza molluginis
- Pyrenopeziza morthieri
- Pyrenopeziza mulgedii
- Pyrenopeziza multipunctoidea
- Pyrenopeziza nervicola
- Pyrenopeziza nigritella
- Pyrenopeziza obtrita
- Pyrenopeziza osiliensis
- Pyrenopeziza pastinacae
- Pyrenopeziza perminuta
- Pyrenopeziza personata
- Pyrenopeziza petiolaris
- Pyrenopeziza pezizelloides
- Pyrenopeziza plicata
- Pyrenopeziza polygoni
- Pyrenopeziza polymorpha
- Pyrenopeziza potentillae
- Pyrenopeziza prinicola
- Pyrenopeziza pseudophacidioides
- Pyrenopeziza pubescens
- Pyrenopeziza pulveracea
- Pyrenopeziza pumilionis
- Pyrenopeziza revincta
- Pyrenopeziza rhaphidospora
- Pyrenopeziza ribesia
- Pyrenopeziza riccia
- Pyrenopeziza rigidae
- Pyrenopeziza rubi
- Pyrenopeziza rubidula
- Pyrenopeziza rugulosa
- Pyrenopeziza ruttneri
- Pyrenopeziza salicis-capreae
- Pyrenopeziza scabiosicola
- Pyrenopeziza soldanellae
- Pyrenopeziza solidaginis
- Pyrenopeziza subatra
- Pyrenopeziza subconica
- Pyrenopeziza subplicata
- Pyrenopeziza thalictri
- Pyrenopeziza tini
- Pyrenopeziza umbellatarum
- Pyrenopeziza urticicola
- Pyrenopeziza vitis
- Pyrenopeziza vossii
- Pyrenopeziza yogoensis