- Ciboria acerina
- Ciboria alni
- Ciboria amentacea
- Ciboria americana
- Ciboria aschersoniana
- Ciboria batschiana
- Ciboria betulae
- Ciboria betulicola
- Ciboria brunneorufa
- Ciboria caespitosa
- Ciboria carbonaria
- Ciboria carniolica
- Ciboria carunculoides
- Ciboria caucus
- Ciboria coryli
- Ciboria filopes
- Ciboria fuscocinerea
- Ciboria gemmincola
- Ciboria gemminicola
- Ciboria glaucescens
- Ciboria hedwigiae
- Ciboria lilacina
- Ciboria liquidambaris
- Ciboria macrospora
- Ciboria minima
- Ciboria ploettneriana
- Ciboria pseudotuberosa
- Ciboria rufofusca
- Ciboria scoparia
- Ciboria seminicola
- Ciboria sessilis
- Ciboria shiraiana
- Ciboria sulfurella
- Ciboria tabacina
- Ciboria viarum
- Ciboria violacea
- Ciboria viridifusca