- Sclerotinia aconitincola
- Sclerotinia angustior
- Sclerotinia bifrons
- Sclerotinia borealis
- Sclerotinia bulborum
- Sclerotinia caricina
- Sclerotinia filipes
- Sclerotinia helvelloidea
- Sclerotinia johanssonii
- Sclerotinia juncigena
- Sclerotinia lentiformis
- Sclerotinia longisclerotialis
- Sclerotinia luzulae
- Sclerotinia minor
- Sclerotinia nyssogena
- Sclerotinia phormii
- Sclerotinia rathenowiana
- Sclerotinia rehmiana
- Sclerotinia richteriana
- Sclerotinia sativa
- Sclerotinia sclerotiorum
- Sclerotinia sulcata
- Sclerotinia tenella
- Sclerotinia trifoliorum
- Sclerotinia trillii
- Sclerotinia veratri