Cylindrosporium acerinum- Cylindrosporium aceris
- Cylindrosporium acicola
- Cylindrosporium acori
- Cylindrosporium alni
- Cylindrosporium andropogonis
- Cylindrosporium angustifoliae
- Cylindrosporium angustifolium
- Cylindrosporium aquilinum
- Cylindrosporium ariaefolium
- Cylindrosporium artemisiae
- Cylindrosporium balsamorrhizae
- Cylindrosporium betulae
- Cylindrosporium brevispinum
- Cylindrosporium calamagrostidis
- Cylindrosporium californicum
- Cylindrosporium canadense
- Cylindrosporium celtidis
- Cylindrosporium cercosporoides
- Cylindrosporium cerris
- Cylindrosporium cervinum
- Cylindrosporium clematidis
- Cylindrosporium colchici
- Cylindrosporium consociatum
- Cylindrosporium corni
- Cylindrosporium crescentum
- Cylindrosporium dearnessii
- Cylindrosporium defolians
- Cylindrosporium defoliatum
- Cylindrosporium dictamni
- Cylindrosporium eminens
- Cylindrosporium eryngii
- Cylindrosporium exiguum
- Cylindrosporium fusarioides
- Cylindrosporium glyceriae
- Cylindrosporium glycyrrhizae
- Cylindrosporium griseum
- Cylindrosporium guttatum
- Cylindrosporium gyrocarpi
- Cylindrosporium hamatum
- Cylindrosporium heraclei
- Cylindrosporium humuli
- Cylindrosporium infuscans
- Cylindrosporium irregulare
- Cylindrosporium juglandis
- Cylindrosporium kaki
- Cylindrosporium kelloggii
- Cylindrosporium kilimandscharicum
- Cylindrosporium komarowii
- Cylindrosporium lactucicola
- Cylindrosporium leonuri
- Cylindrosporium lippiae
- Cylindrosporium lutescens
- Cylindrosporium matricariae
- Cylindrosporium microspilum
- Cylindrosporium minus
- Cylindrosporium montenegrinum
- Cylindrosporium negundinis
- Cylindrosporium niveum
- Cylindrosporium nuttallii
- Cylindrosporium onobrychidis
- Cylindrosporium phaceliae
- Cylindrosporium phalaridis
- Cylindrosporium phaseoli
- Cylindrosporium pimpinellae
- Cylindrosporium platanoidis
- Cylindrosporium pollaccii
- Cylindrosporium populinum
- Cylindrosporium pseudoplatani
- Cylindrosporium pulchrum
- Cylindrosporium ranunculi
- Cylindrosporium rhamni
- Cylindrosporium rubi
- Cylindrosporium saccharinum
- Cylindrosporium salicifoliae
- Cylindrosporium salicinum
- Cylindrosporium saponariae
- Cylindrosporium saximontanense
- Cylindrosporium scrophulariae
- Cylindrosporium septatum
- Cylindrosporium shepherdiae
- Cylindrosporium siculum
- Cylindrosporium smilacinae
- Cylindrosporium smilacis
- Cylindrosporium solitarium
- Cylindrosporium spiraeicola
- Cylindrosporium stachydis
- Cylindrosporium steironematis
- Cylindrosporium tenuisporum
- Cylindrosporium thalictrinum
- Cylindrosporium thesii
- Cylindrosporium triostei
- Cylindrosporium tubeufianum
- Cylindrosporium ulmicola
- Cylindrosporium umbelliferarum
- Cylindrosporium urticae
- Cylindrosporium utahense
- Cylindrosporium veratrinum
- Cylindrosporium violae
- Cylindrosporium viridis