- Fusarium acutatum
- Fusarium adesmiae
- Fusarium albidum
- Fusarium albosuccineum
- Fusarium andinum
- Fusarium andropogonis
- Fusarium anthophilum
- Fusarium arthrosporioides
- Fusarium baccharidicola
- Fusarium bactridioides
- Fusarium bagnisianum
- Fusarium baptisiae
- Fusarium begoniae
- Fusarium betae
- Fusarium caeruleum
- Fusarium carniformis
- Fusarium cesatii
- Fusarium chlamydosporum
- Fusarium cicatricum
- Fusarium cinerea
- Fusarium coeruleum
- Fusarium concentricum
- Fusarium culmorum
- Fusarium cyanostomum
- Fusarium denticulatum
- Fusarium derridis
- Fusarium detonianum
- Fusarium discolor
- Fusarium eichleri
- Fusarium elegans
- Fusarium eleocharidis
- Fusarium equisetorum
- Fusarium eucalypticola
- Fusarium evonymi-japonici
- Fusarium evonymi
- Fusarium globulosum
- Fusarium graminum
- Fusarium guttiforme
- Fusarium heveae
- Fusarium hibernans
- Fusarium incarnatum
- Fusarium japonicum
- Fusarium juglandinum
- Fusarium lactis
- Fusarium limonis
- Fusarium longisporum
- Fusarium magnusianum
- Fusarium metachroum
- Fusarium minimum
- Fusarium mollerianum
- Fusarium nectriae-palmicolae
- Fusarium neocosmosporiellum
- Fusarium osiliense
- Fusarium oxysporum
- Fusarium pannosum
- Fusarium paspali
- Fusarium peltigerae
- Fusarium pentaclethrae
- Fusarium phragmiticola
- Fusarium phyllachorae
- Fusarium poae
- Fusarium pseudocircinatum
- Fusarium pseudonygamai
- Fusarium ramigenum
- Fusarium roseum
- Fusarium rubiginosum
- Fusarium salicis
- Fusarium serjaniae
- Fusarium sophorae
- Fusarium sorghi
- Fusarium stercoris
- Fusarium stillatum
- Fusarium stromaticola
- Fusarium subulatum
- Fusarium urticearum
- Fusarium ustilaginis
- Fusarium vogelii
- Fusarium ziziphinum