- Colletotrichum aletridis
- Colletotrichum althaeae
- Colletotrichum ampelinum
- Colletotrichum andropogonis
- Colletotrichum arecae
- Colletotrichum artocarpi
- Colletotrichum blighiae
- Colletotrichum bromi
- Colletotrichum calotropidis
- Colletotrichum capsici
- Colletotrichum carpophilum
- Colletotrichum catechu
- Colletotrichum caudatum
- Colletotrichum caulicola
- Colletotrichum cerei
- Colletotrichum cinchonae
- Colletotrichum cinnamomi
- Colletotrichum circinans
- Colletotrichum clerodendri
- Colletotrichum coccodes
- Colletotrichum consociatum
- Colletotrichum crassipes
- Colletotrichum curcumae
- Colletotrichum curvatum
- Colletotrichum dematium
- Colletotrichum destructivum
- Colletotrichum dianellae
- Colletotrichum durionis
- Colletotrichum effiguratum
- Colletotrichum elasticae
- Colletotrichum eleusines
- Colletotrichum elmeri
- Colletotrichum erythrinae
- Colletotrichum euchroum
- Colletotrichum fragariae
- Colletotrichum fuscum
- Colletotrichum gloeosporioides
- Colletotrichum gloesporioides
- Colletotrichum gnaphalii
- Colletotrichum gossypii
- Colletotrichum graminicola
- Colletotrichum griseum
- Colletotrichum guajaci
- Colletotrichum guaraniticum
- Colletotrichum hederae
- Colletotrichum hedericola
- Colletotrichum helianthi
- Colletotrichum helichrysi
- Colletotrichum helicis
- Colletotrichum higginsianum
- Colletotrichum holci
- Colletotrichum humuli
- Colletotrichum idaeinum
- Colletotrichum jahnii
- Colletotrichum jussiaeae
- Colletotrichum liliacearum
- Colletotrichum lindemuthianum
- Colletotrichum lineola
- Colletotrichum lobeliae
- Colletotrichum lupini
- Colletotrichum lussoniense
- Colletotrichum luzulae
- Colletotrichum lycopersici
- Colletotrichum magnusianum
- Colletotrichum malvarum
- Colletotrichum manihotis
- Colletotrichum montemartinii
- Colletotrichum musae
- Colletotrichum nigrum
- Colletotrichum nymphaeae
- Colletotrichum omnivorum
- Colletotrichum orchidearum
- Colletotrichum paludosum
- Colletotrichum pandani
- Colletotrichum papayae
- Colletotrichum philodendri
- Colletotrichum phyllachoroides
- Colletotrichum phyllocacti
- Colletotrichum pisi
- Colletotrichum poinsettiae
- Colletotrichum pollaccii
- Colletotrichum pothi
- Colletotrichum pruni-domesticae
- Colletotrichum quercinum
- Colletotrichum revolutum
- Colletotrichum rhexiae
- Colletotrichum salicis
- Colletotrichum sassafras
- Colletotrichum silphii
- Colletotrichum smilacis
- Colletotrichum solitarium
- Colletotrichum sordidum
- Colletotrichum spaethianum
- Colletotrichum stanhopeae
- Colletotrichum staphyleae
- Colletotrichum stevensii
- Colletotrichum sublineola
- Colletotrichum sumbaviae
- Colletotrichum toluiferae
- Colletotrichum trichellum
- Colletotrichum trifolii
- Colletotrichum truncatum
- Colletotrichum typhae
- Colletotrichum vanillae
- Colletotrichum vermicularioides
- Colletotrichum violae-tricoloris
- Colletotrichum violae