Microbotryum afromontanum- Microbotryum alsines
- Microbotryum anomalum
- Microbotryum aviculare
- Microbotryum bistortarum
- Microbotryum bosniacum
- Microbotryum cardui
- Microbotryum cichorii
- Microbotryum cilinode
- Microbotryum claytoniae
- Microbotryum cordae
- Microbotryum coronatum
- Microbotryum dehiscens
- Microbotryum dianthorum
- Microbotryum duriaeanum
- Microbotryum emodensis
- Microbotryum filamenticola
- Microbotryum flosculorum
- Microbotryum gayophyti
- Microbotryum goeppertianum
- Microbotryum holostei
- Microbotryum intermedium
- Microbotryum koenigiae
- Microbotryum kuehneanum
- Microbotryum longisetum
- Microbotryum lychnidis-dioicae
- Microbotryum major
- Microbotryum marginale
- Microbotryum moenchiae-manticae
- Microbotryum nelsonianum
- Microbotryum nepalense
- Microbotryum nivale
- Microbotryum ocrearum
- Microbotryum onopordi
- Microbotryum parlatorei
- Microbotryum pinguiculae
- Microbotryum piperi
- Microbotryum polygoni-alati
- Microbotryum prostratum
- Microbotryum reticulatum
- Microbotryum rhei
- Microbotryum saponariae
- Microbotryum scabiosae
- Microbotryum scolymi
- Microbotryum scorzonerae
- Microbotryum shastense
- Microbotryum silenes-inflatae
- Microbotryum silybum
- Microbotryum stellariae
- Microbotryum stewartii
- Microbotryum stygium
- Microbotryum succisae
- Microbotryum superbum
- Microbotryum tenuisporum
- Microbotryum tragopogonis-pratensis
- Microbotryum tuberculiforme
- Microbotryum vinosum
- Microbotryum violaceoirregulare
- Microbotryum violaceoverrucosum
- Microbotryum violaceum
- Microbotryum warmingii