Phragmidium acaenicola- Phragmidium acaenincola
- Phragmidium acuminatum
- Phragmidium affine
- Phragmidium alaskanum
- Phragmidium alpinum
- Phragmidium americanum
- Phragmidium andersonii
- Phragmidium arcticum
- Phragmidium assamense
- Phragmidium bayatii
- Phragmidium biloculare
- Phragmidium brevipedicellatum
- Phragmidium bulbosum
- Phragmidium butleri
- Phragmidium circumvallatum
- Phragmidium constrictosporum
- Phragmidium devastator
- Phragmidium egenulum
- Phragmidium fragariae
- Phragmidium fusiforme
- Phragmidium griseum
- Phragmidium guatemalense
- Phragmidium handelii
- Phragmidium heterosporum
- Phragmidium horkeliae
- Phragmidium incompletum
- Phragmidium itoanum
- Phragmidium ivesiae
- Phragmidium jonesii
- Phragmidium kamtschatkae
- Phragmidium mexicanum
- Phragmidium miyabeanum
- Phragmidium miyakeanum
- Phragmidium montivagum
- Phragmidium mucronatum
- Phragmidium nambuanum
- Phragmidium occidentale
- Phragmidium orientale
- Phragmidium papillatum
- Phragmidium pauciloculare
- Phragmidium peckianum
- Phragmidium potentillae-canadensis
- Phragmidium potentillae
- Phragmidium rosae-arkansanae
- Phragmidium rosae-californicae
- Phragmidium rosae-davuricae
- Phragmidium rosae-lacerantis
- Phragmidium rosae-moschatae
- Phragmidium rosae-multiflorae
- Phragmidium rosae-pimpinellifoliae
- Phragmidium rosae-rugosae
- Phragmidium rosicola
- Phragmidium rubi-idaei
- Phragmidium rubi-japonici
- Phragmidium rubi-odorati
- Phragmidium rubi-oldhami
- Phragmidium sanguisorbae
- Phragmidium shogranense
- Phragmidium speciosum
- Phragmidium tuberculatum
- Phragmidium violaceum
- Phragmidium yamadanum