Rhaphidostegium aberrans- Rhaphidostegium adhaerens
- Rhaphidostegium afrolithophilum
- Rhaphidostegium aureolum
- Rhaphidostegium callidum
- Rhaphidostegium cavifolium
- Rhaphidostegium chiquitanum
- Rhaphidostegium chlorocormum
- Rhaphidostegium condensatulum
- Rhaphidostegium conterminum
- Rhaphidostegium cylindrothecium
- Rhaphidostegium diaphanodictyon
- Rhaphidostegium distichium
- Rhaphidostegium elgonense
- Rhaphidostegium elgonensis
- Rhaphidostegium eurycystis
- Rhaphidostegium glaucinum
- Rhaphidostegium hoehnei
- Rhaphidostegium jamesii
- Rhaphidostegium lozanoi
- Rhaphidostegium masafuerae
- Rhaphidostegium microstegium
- Rhaphidostegium molle
- Rhaphidostegium ovalifolium
- Rhaphidostegium patagonicum
- Rhaphidostegium perrevolutum
- Rhaphidostegium philippinense
- Rhaphidostegium purpureoaxis
- Rhaphidostegium scorpiurus
- Rhaphidostegium secundifolium
- Rhaphidostegium semi-tortulum
- Rhaphidostegium subcaespitosum
- Rhaphidostegium subleptorhynchoides
- Rhaphidostegium tristiculum