- Batrachospermum anatinum
- Batrachospermum angolense
- Batrachospermum antipodites
- Batrachospermum arcuatum
- Batrachospermum atrum
- Batrachospermum boryanum
- Batrachospermum brasiliense
- Batrachospermum breutelii
- Batrachospermum campyloclonum
- Batrachospermum carpocontortum
- Batrachospermum cayennense
- Batrachospermum ceylanicum
- Batrachospermum chalybaeum
- Batrachospermum confusum
- Batrachospermum depauperatum
- Batrachospermum diatyches
- Batrachospermum ectocarpum
- Batrachospermum elegans
- Batrachospermum equisetifolium
- Batrachospermum fluitans
- Batrachospermum gelatinosum
- Batrachospermum globosporum
- Batrachospermum helminthosum
- Batrachospermum heterocorticum
- Batrachospermum keratophytum
- Batrachospermum kuhneanum
- Batrachospermum macrosporum
- Batrachospermum mimitissimum
- Batrachospermum monile
- Batrachospermum moniliforme
- Batrachospermum occidentale
- Batrachospermum orthostichum
- Batrachospermum procarpum
- Batrachospermum puiggarianum
- Batrachospermum pyramidale
- Batrachospermum skujae
- Batrachospermum spermatiophorum
- Batrachospermum sporulans
- Batrachospermum thwaitesii
- Batrachospermum turfosum
- Batrachospermum virgato-decaisneanum
- Batrachospermum vogesiacum
- Batrachospermum zeylanicum