Aponogeton abyssinicus- Aponogeton afroviolaceus
- Aponogeton angustifolius
- Aponogeton appendiculatus
- Aponogeton azureus
- Aponogeton bernierianus
- Aponogeton bogneri
- Aponogeton boivinianus
- Aponogeton bruggenii
- Aponogeton bullosus
- Aponogeton capuronii
- Aponogeton cordatus
- Aponogeton crispus
- Aponogeton cuneatus
- Aponogeton decaryi
- Aponogeton desertorum
- Aponogeton dioecus
- Aponogeton distachyos
- Aponogeton distachyus
- Aponogeton elongatus
- Aponogeton fenestrale
- Aponogeton gottlebei
- Aponogeton hexatepalus
- Aponogeton jacobsenii
- Aponogeton junceus
- Aponogeton lakhonensis
- Aponogeton lancesmithii
- Aponogeton longiplumulosus
- Aponogeton loriae
- Aponogeton madagascariensis
- Aponogeton natalense
- Aponogeton natalensis
- Aponogeton natans
- Aponogeton nudiflorus
- Aponogeton queenslandicus
- Aponogeton ranunculiflorus
- Aponogeton rehmannii
- Aponogeton rigidifolius
- Aponogeton robinsonii
- Aponogeton satarensis
- Aponogeton stuhlmannii
- Aponogeton subconjugatus
- Aponogeton tenuispicatus
- Aponogeton troupinii
- Aponogeton ulvaceus
- Aponogeton undulatus
- Aponogeton vallisnerioides
- Aponogeton vanbruggenii
- Aponogeton womersleyi