Trypanosoma ambystomae- Trypanosoma anolisi
- Trypanosoma avium
- Trypanosoma catostomi
- Trypanosoma cervi
- Trypanosoma cnemaspi
- Trypanosoma cordyli
- Trypanosoma fairchildi
- Trypanosoma floridana
- Trypanosoma froesi
- Trypanosoma gargantua
- Trypanosoma hydrae
- Trypanosoma kansasensis
- Trypanosoma khani
- Trypanosoma kimbozae
- Trypanosoma lygodactyli
- Trypanosoma magdalenae
- Trypanosoma manulis
- Trypanosoma melophagium
- Trypanosoma murmanense
- Trypanosoma ohiocephali
- Trypanosoma pacifica
- Trypanosoma plicaplicae
- Trypanosoma poinsetti
- Trypanosoma pseudopodia
- Trypanosoma pulchra
- Trypanosoma scincorum
- Trypanosoma serveti
- Trypanosoma takydromi
- Trypanosoma tamiasi
- Trypanosoma thecadactyli
- Trypanosoma theileri
- Trypanosoma trichogaster
- Trypanosoma ulugurense
- Trypanosoma urosauri
- Trypanosoma yaegeri
- Trypanosoma zonuri