- Didymium anellus
- Didymium annulisporum
- Didymium atrichum
- Didymium bahiense
- Didymium clavodecus
- Didymium clavus
- Didymium comatum
- Didymium complanatum
- Didymium crustaceum
- Didymium decipiens
- Didymium difforme
- Didymium dubium
- Didymium eximium
- Didymium flexuosum
- Didymium floccosum
- Didymium intermedium
- Didymium iridis
- Didymium karstensii
- Didymium laxifilum
- Didymium listeri
- Didymium megalosporum
- Didymium melanospermum
- Didymium minus
- Didymium nigripes
- Didymium nivicolum
- Didymium obducens
- Didymium ochroideum
- Didymium orthonemata
- Didymium ovoideum
- Didymium panniforme
- Didymium perforatum
- Didymium quitense
- Didymium reticulosporum
- Didymium saturnus
- Didymium serpula
- Didymium squamulosum
- Didymium sturgisii
- Didymium trachysporum
- Didymium vaccinum
- Didymium verrucosporum