- Caloneis aerophila
- Caloneis alpestris
- Caloneis amphisbaena
- Caloneis bacillaris
- Caloneis bacillum
- Caloneis bicuneata
- Caloneis brevis
- Caloneis crassa
- Caloneis fenzlii
- Caloneis formosa
- Caloneis fusioides
- Caloneis hebes
- Caloneis inliberalis
- Caloneis latiuscula
- Caloneis lauta
- Caloneis lewisii
- Caloneis liber
- Caloneis limosa
- Caloneis mexicana
- Caloneis molaris
- Caloneis permagna
- Caloneis robusta
- Caloneis trinodis
- Caloneis ventricosa
- Caloneis westi